我國科學家日前完成了包羅毛竹葉片、筍和萌發(fā)種子等在內(nèi)的毛竹全長cDNA文庫構建，并正確測定了1萬余條基因序列。
這是公共數(shù)據(jù)庫中繼水稻和擬南芥以外，第三大的植物全長cDNA數(shù)據(jù)信息資本，第一次提供了大量竹亞科基因序列信息，填補了禾本科植物比較基因組學研究的一個空缺，為進一步的基因組測序設計提供了有用的基因注釋依據(jù)。
毛竹全長cDNA文庫構建和基因序列正確測定，是“毛竹基因組測序研究”重大科研項目的第一部門。該項目由財政部、科技部支持，國家林業(yè)局行業(yè)科研專項立項重點支持，中國林業(yè)科學研究院林研所、國際竹藤網(wǎng)絡中心與中國科學院國家基因研究中心互助肩負。
科學家們在完成毛竹全長cDNA文庫構建并正確測定1萬余條基因序列的同時，還首次根據(jù)毛竹大規(guī)模的基因序列統(tǒng)計了毛竹基因的一些基本信息，包羅GC含量、密碼子使用偏好性、簡單重復序列、小分子RNA和轉(zhuǎn)座子的統(tǒng)計等。另外，科學家們根據(jù)判定到的42組禾本科同源基因，舉行了系統(tǒng)發(fā)育樹分解，分解顯示毛竹與水稻具有最近的進化關系。這對禾本科植物的進一步研究提供了極其重要的信息，對林業(yè)領域基因組學研究是一個重大突破。
同時，作為大規(guī)模開展毛竹基因組測序的下午性基礎研究工作，科學家們還順利完成了兩套高質(zhì)量、高覆蓋率的毛竹BAC文庫構建工作，為全面開展毛竹基因組測序研究的各項預研工作做好了準備。
毛竹是天下上較重要的竹類植物之一，也是我國分布范圍較廣、栽植面積較大、經(jīng)濟價值較高的竹種，在禾本科植物中占有特殊的職位。而禾本科類植物是人類獲取食物和潛在可再生能源的重要來源。為了舉行更全面的比較基因組學的研究，科學工作者需要不停積累來自于不同種類的禾本科植物的基因信息和基因組信息?，F(xiàn)在，在公共數(shù)據(jù)庫中，禾本科的大多數(shù)亞科(跨越100個種類)都有大量相應的基因組信息或表達信息，只有竹亞科(包羅約1000多個種類)僅有少量的序列信息。毛竹全長cDNA文庫構建的完成和1萬余條基因序列的正確測定填補了這一方面的空缺。